الألوان
يتألف الشعار من اللونين الأبيض والأزرق.
يتكون الشعار من لوح حفظ القران الكريم ويحتوي من الأعلى على اسم الجامعة باللغتين العربية والانجليزية باللون الأزرق. ثم كتاب مفتوح يرمز للعلم والتحصيل باللون الأزرق أيضا. وفي الوسط كلمة التوحيد ( لا اله إلا الله ) والتي ترمز للراية التي رفعتها الثورة المهدية حيث جاءت لرفع ونصرة راية الإسلام ونصرة دين نبيه محمد صلى الله عليه وسلم وإحياء سنة الجهاد, كما قال الإمام محمد احمد المهدي ( انا عبد مأمور بإحياء الكتاب والسنة المقبورين حتى يستقيما ).
تصميم الشعار
قــــــام بتصميم الشـــــــعار
الأستاذ / شـــــــــاكر شوقار
الأستاذة / إخلاص محمد أحمد الإمام