هو مركز دراسات و أبحاث طبي وتدريبي مرجعي ورائد على المستوى الوطني والعالمي في تشخيص ورصد الأمراض المتوطنة

          جامعة الإمام المهدي واحدة من أوائل ثمار ثورة التعليم العالي المنتشرة في الولايات وتتميز بوجودها في ولاية النيل الأبيض ذات الموقع الجغرافي في المنطقة المدارية والبيئة النيلية الجاذبة للمشاريع التنموية والزراعية ، علاوة علي وجود وحدات ومؤسسات صحية فاعلة بالولاية ، وهذه العوامل  تمثل من وجهة النظر الصحية عوامل نجاح للمشاريع والبرامج المعززة للصحة حال استخدام هذه الموارد الاستخدام الأمثل ، إلا أنه من جهة أخري قد يكون المردود سلبياً علي الصحة مما يؤدي لانتشار الأوبئة وتوطن بعض الأمراض فيها مثل أمراض الملا ريا ، البلهارسيا والسل الرئوي وغيرها من الأمراض المدرجة في قائمة الأمراض المتوطنة في السودان .

وتحصيلاً للمنفعة القصوي من الموارد البشرية والمادية بالجامعة والمؤسسات الصحية القائمة بالولاية نِشأت بذرة التفكير والسعي لتأسيس مركز دراسات وأبحاث الأمراض المتوطنة -  بجامعة الإمام المهدي  لتعزيز وإ جراء دراسات و أبحاث طبية تطبيقية ميدانية  عالية الجودة للأمراض المتوطنة  بالسودان وبولاية النيل الأبيض  علي وجه الخصوص   للساهمة في وضع الخطط الوقائية والعلاجية لتلك الأمراض تكون مبنية علي أسس علمية ميدانية . وتعزيزا  لثقافه التطوير والتدريب المهني المستمر لجميع الاطر الصحيه وفق المناهج المواكبه .